Por que primero se deben de eliminar los folders de el folder installation, se le da clic al folder y aparecerán  todos los subfolder de installation , se elimina uno por uno  y ya que esten todos eliminados podemos eliminar el  folder installation . 

De tal manera que una ves eliminado el folder installation podremos utilizar en joomla.

Nota esto aplica principalmente al administrador de archivos dentro del control panel, si se elimina el folder por medio de ftp automaticamente eliminara los subfolders.